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iPSC神经分化“细胞因子语言”全解码——从多能到特异,精准构建神经微世界的编程指南

2025/12/01
EastMabBio

“把iPSC扔进培养皿,就能长出大脑”——这句2025年的今天已不再夸张。然而真正的挑战不在于,而是“长对”:你要的是能分泌多巴胺的腹侧中脑神经元还是支配肌肉收缩脊髓运动神经元参与认知皮质谷氨酸能神经元,还能整合进皮层微环路的GABA能中间神经元?抑或是神经元提供支持星形胶质细胞髓鞘形成细胞——少突胶质细胞

本文系统梳理了iPSC定向分化为五大经典神经细胞类型的“细胞因子指令集”,把最常用、最难找、最容易踩坑的因子、小分子、时间窗一次讲透

通用“0→1”:神经外胚层诱导——推开神经发育之门


核心发育逻辑:无论终点是什么分化的一步都是把iPSC从“多能”推向“神经外胚层”。“双SMAD抑制” 策略是目前最高效的方法:通过同时抑制BMPTGF-β/Activin A两条关键的发育信号通路,解除对神经分化的抑制,促使细胞形成神经玫瑰花环结构,进一步成为神经前体细胞(NPCs)

关键因子与时间窗

Day0–10(前脑/皮质命运指定)

Noggin/LDN-193189BBMP抑制剂,Noggin通过抑制BMP信号,解除对神经分化的刹车,是启动神经命运的经典因子。

SB-431542TGF-β/Activin A抑制剂,进一步消除非神经分化的干扰,与Noggin协同,高效地将细胞命运推向神经轨道。

CHIR99021(可选):GSK-3β抑制剂,适度激活Wnt信号。

FGF-2:诱导早期起到促进细胞存活、增殖,并协同促进神经前体细胞形成。



路线A:腹侧中脑多巴胺能神经元(mDA)——帕金森治疗的“希望种子”


核心发育逻辑:多巴胺能神经元位于中脑黑质,其退行性死亡是导致帕金森病的主要原因。模拟胚胎中脑发育过程,依次实现“神经诱导→腹侧化→中脑化→成熟”特化为中脑腹侧的多巴胺能神经元。

关键因子与时间窗

Day0-10(前脑/皮质命运指定)

SMAD抑制:基础步骤。

Day11-30(腹侧化和中脑化)

SHH:最关键的腹侧化信号。SHH的梯度浓度至关重要,通常与激动剂PurmoSAG联用,精确地将神经前体细胞向腹侧中脑诱导。

FGF-8b:关键的中脑化信号。与SHH协同作用,特异性驱动前体细胞向中脑多巴胺能神经元分化。

CHIR99021:适度激活Wnt通路,对于中脑多巴胺能神经元的存活和成熟至关重要。但浓度需要精确控制,过强的Wnt信号会导致细胞命运偏离。

BDNF:开始促进神经元的存活和初始分化。

抗坏血酸(VC):抗氧化剂,显著促进多巴胺能神经元的成熟,增强其电生理活性,并提高酪氨酸羟化酶的表达。

Day31+(成熟阶段)

BDNFGDNF:是多巴胺能神经元的存活因子,能显著增强其存活率和酪氨酸羟化酶的表达,并促进神经突触生长。

TGF-β3:增强多巴胺能神经元的分化和成熟。

抗氧化物:继续使用,保护其免受氧化应激损伤。


鉴定标志物:酪氨酸羟化酶(TH+)、转录因子Nurr1NR4A2+)、Pitx3FoxA2


路线B:脊髓运动神经元(MN)——渐冻症(ALS)“突触重建者”


核心发育逻辑:运动神经元位于脊髓腹角,其轴突投射至肌肉,控制自主运动。其分化策略核心是通过尾侧化腹侧化路径。先将神经前体细胞指定为脊髓身份,再进一步腹侧化为运动神经元。

关键因子与时间窗

Day0-10(神经诱导与尾侧化阶段)

SMAD抑制+视黄酸(RA):通过最强尾侧化信号RA,激活特定的Hox基因家族,引导神经前体细胞获得脊髓身份。

Day11-20(腹侧化与运动神经元特化阶段)

SHH:在RA提供了脊髓背景后,SHH负责极端的腹侧化。高浓度的SHH(或其激动剂)会将细胞命运推向脊髓腹侧最末端,从而特化为运动神经元前体。

视黄酸(RA):RASHH协同,进一步促进运动神经元特异性转录因子的表达。

Day21+(成熟阶段)

神经营养因子BDNFGDNFCNTF:三者共同作用,为运动神经元提供强有力的存活支持,促进其神经突的延伸,并引导其与肌肉细胞形成功能性神经肌肉接头。

IGF-1:促进运动神经元的存活和成熟。

DAPTNotch信号抑制剂,促使细胞退出细胞周期,加速终末分化。


鉴定标志物:转录因子Islet-1Isl1+)、HB9MNX1+)、胆碱乙酰转移酶(ChAT+)。


路线C:皮质谷氨酸能神经元(CN)——阿尔茨海默病(AD)“记忆重构师”


核心发育逻辑:大脑皮层的兴奋性神经元主要由谷氨酸能神经元构成,负责高级认知功能。其分化相对复杂,涉及层状特化。在神经诱导基础上,抑制腹侧化信号,并适时调控Wnt/β-catenin通路。

关键因子与时间窗

Day0-15前脑/皮质命运指定

SMAD抑制:基础步骤。

Wnt信号抑制:与脊髓分化相反,皮质分化需要抑制Wnt信号。常用小分子抑制剂如IWR-1DKK-1确保神经前体细胞获得前脑身份。

SHH信号抑制:环巴胺等SHH抑制剂可以防止细胞向腹侧命运偏移,确保其向背侧皮质谷氨酸能神经元发展。

Day16-30(皮质神经元生成与层状特化)

FGF-2:促进放射状胶质细胞的扩增。

时序性调控:深层的皮层神经元会先产生,而浅层的神经元后产生。在体外,可以通过控制分化时长来富集特定层次的神经元。视黄酸的晚期加入可能有助于上层皮质神经元的生成。

BDNF:开始促进新生神经元的存活和初步分化。

Day31+成熟阶段

BDNF皮质神经元存活和突触成熟的关键因子

NT-3:对皮质神经元的发育有促进作用。


鉴定标志物:Tbr1(深层),Ctip2(第五层),Satb2(第二/三层),VGlut1(谷氨酸能神经元标志)。


路线D:MGE型GABA能中间神经元——癫痫“微环路修理工”

核心发育逻辑:GABA能中间神经元是大脑中主要的抑制性神经元,起源于胚胎时期的腹侧端脑(内侧神经节隆起,MGE)。需要在获得前脑身份的基础上,进行强烈的“腹侧化”。

关键因子与时间窗

Day0-10前脑/皮质命运指定

SMAD抑制:基础步骤。

Day11-30(腹侧化与MGE特化):

SHH高浓度:决定性步骤。使用较高浓度的SHH或其激动剂(SAG),将前脑前体细胞特化为腹侧端脑的MGE命运,GABA能中间神经元的主要来源。

FGF:与SHH协同作用。

Day31+(成熟阶段):

BDNF、GDNF:支持GABA能神经元的成熟和存活。

撤除DKK1:在分化后期撤除Wnt抑制剂,有助于GABA能神经元表达的神经肽(SSTPV)的成熟。

DAPT:分化后期加入Notch抑制剂,可以促使细胞退出细胞周期,加速其终末分化。


鉴定标志物:GABAGAD67,以及特定亚型标志物如小清蛋白(PV+)、生长抑素(SST+)。


路线E:神经胶质细胞——不可或缺的“支持细胞”

星形胶质细胞

星形胶质细胞为神经元提供营养支持、维持离子平衡、参与突触功能调节。

关键因子与时间窗

Day0-14(神经前体细胞生成)

双SMAD抑制:常规步骤。
Day15-60(胶质命运诱导与分化)
CNTF:通过JAK-STAT通路强力促进胶质分化。
LIF:同样激活JAK-STAT通路,与CNTF有协同效应。
BMP-4:在胶质分化阶段,BMP信号从抑制因子转变为促进因子,能强力诱导星形胶质细胞分化,上调GFAP表达。
FGF-1/FGF-2:继续使用FGF,可以促进星形胶质前体细胞的增殖。
Day60+(成熟期)
撤去有丝分裂原FGF-2,将细胞在含CNTF、LIFBMP-4的培养基中继续培养数周。

鉴定标志物:GFAP,S100β,AQP4,Sox9。

少突胶质细胞

少突胶质细胞负责形成髓鞘,包裹神经元轴突,确保神经信号快速、准确地传递。

关键因子与时间窗:

Day0-20(神经诱导与脊髓/腹侧化模式化)
双SMAD抑制:常规步骤。
视黄酸 (RA):提供尾侧化信号,指定脊髓身份。
SHH:提供腹侧化信号,腹侧脊髓来源的OPC分化效率更高。
CHIR99021:适度激活Wnt信号,与SHH协同优化腹侧模式化。
Day21-60(少突胶质前体细胞的诱导与扩增)
RA和SHH:阶段初期继续使用,以维持促进OPC产生的环境。
PDGF-AA:OPC最重要的有丝分裂原和存活因子。能强力促进OPC的增殖和迁移,是扩增细胞的关键。
FGF-2:与PDGF-AA协同作用,高效扩增OPCs。
T3:此阶段后期加入。T3是少突胶质细胞分化的强效启动因子,它开始促使部分OPCs退出细胞周期,启动分化程序。
Day61+(终末分化与髓鞘化)
撤除PDGF-AA和FGF-2:解除其对细胞增殖的驱动,迫使细胞退出细胞周期,进入终末分化。
T3:驱动终末分化最关键的因子。在此阶段,需要提高T3的浓度,以强力、同步地驱动分化程序。
RA:继续使用RA,与T3协同促进分化成熟。
cAMP激活剂:提升细胞内cAMP水平,进一步增强少突胶质细胞的成熟和髓鞘蛋白的表达。
IGF-1:支持少突胶质细胞的存活和成熟。

鉴定标志物:O4(晚期前体),O1(成熟),MBPPLP(成熟髓鞘)。

                                                                                               EastMabBio

东抗视角

iPSC神经定向分化是一条由一系列细胞因子精密编排的、不可逆转的“单行道”。每一步的走向,都依赖于特定细胞因子在正确的时间、以正确的浓度和活性出现。

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参考文献

1. Highly efficient neural conversion of human ES and iPS cells by dual inhibition of SMAD signaling. Nat Biotechnol. 2009.

2. Multiple factors to assist human-derived induced pluripotent stem cells to efficiently differentiate into midbrain dopaminergic neurons. Neural Regen Res. 2024.

3. Edaravone activates the GDNF/RET neurotrophic signaling pathway and protects mRNA-induced motor neurons from iPS cells. Mol Neurodegener. 2022.

4. Directed differentiation and functional maturation of cortical interneurons from human embryonic stem cells. Cell Stem Cell. 2013.

5. Neuronal cell differentiation of iPSCs for the clinical treatment of neurological diseases. Biomedicines. 2024.


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